Министарство здравља и социјалне заштите обавља управне и друге стручне послове у вези са промоцијом, унапређивањем, контролом и заштитом здравља становништва, јавног здравства, здравственом заштитом, здравственим системом, фармацијом, социјалном, породичном и дјечјом заштитом, кроз:1)
праћење савремених достигнућа у развоју јавног здравства у свијету у циљу развоја јавног здравства у Републици;
планирање и припремање стратешких планских докумената у области јавног здравства;
хармонизацију и испуњавање услова у процесу Европских интеграција у области јавног здравства;
сарадњу са владиним, невладиним, филантропским институцијама и организацијама, приватним фондацијама и заједницом у области јавног здравства;
подстицање и одржавање међународне сарадње;
организацију разних врста састанака у области јавног здравства и међународне сарадње;
функције Института за јавно здравство (праћење, процјена и анализа здравственог стања становништва; праћење и проучавање здравствених проблема и ризика по здравље; активности на промоцији здравља и превенцији болести, информисање становништва о значају очувања и унапређивања здравља; обављање бактериолошких, паразитолошких, вирусолошких, серолошких, хемијских и токсиколошких прегледа и испитивања у вези са производњом и прометом животних намирница, воде, ваздуха, предмета опште употребе; планирање, контрола и евалуација послова дезинфекције, дезинсекције и дератизације; вођење евиденција, здравствене статистике и обављање истраживања у области јавног здравства; анализу и праћење здравственог стања и здравствених потреба становништва; утврђивање потребних мјера у елементарним и другим већим непогодама и несрећама; обављање послова из области заштите здравља становништва и околине од зрачења);
припрему и спровођење здравствених политика и здравствених стратегија;
процјену резултата примјене здравствених политика и здравствених стратегија, планова и програма;
обављање нормативних послова и управних поступака из надлежности Министарства;
утврђивање испуњености услова у погледу кадра, простора и опреме за почетак рада здравствених установа;
вођење Регистра здравствених установа;
спровођење процедуре избора органа здравствених установа чији је оснивач Република;
давање мишљења на статуте здравствених установа;
давање сагласности на правилнике о организацији и систематизацији радних мјеста установа;
разматрање и усвајање годишњег плана рада здравствених установа чији је оснивач Република;
разматрање и усвајање годишњег извјештаја о пословању здравствених установа чији је оснивач Република;
унапређивање система квалитета здравствене заштите;
организацију здравственог система;
надзор над радом здравствених установа;
планирање и примјену здравствених технологија у здравственим установама;
стручно усавршавање здравствених радника и здравствених сарадника;
врсте и трајање специјализација и супспецијализација, програме специјализација и супспецијализација;
додјелу звања примаријуса;
нострификација дипломе о завршеној специјализацији и супспецијализацији здравственог радника и нострификација дипломе о завршеној специјализацији здравственог сарадника;
примјену и надзор над одобреним програмима и пројектима и презентацију резултата њиховог спровођења на домаћим и међународним конференцијама;
сарадњу са институцијама и другим организацијама у здравственом систему, струковним удружењима здравствених радника, међународним здравственим организацијама и невладиним организацијама из области здравства;
организовање полагања стручних испита за здравствене раднике и здравствене сараднике;
обављање студијско-аналитичких послова у вези са примјеном нових концепата и модела организације здравствене заштите који су спроведени у земљама Европске уније;
припрему детаљне пројектне документације у складу са најбољим праксама Европске уније и Свјетске банке и УН организација, укључујући и планове набавки и финансијске аранжмане на основу најбољих искустава у свијету;
припрему стратегија реализације и реализационих планова за одобрене програме и пројекте;
припрему крајњих корисника (здравствене установе) за реализацију програма и пројеката;
реализацију програма и пројеката;
надгледање и оцјену резултата реализованих програма и пројеката на основу дефинисаних индикатора праћења;
презентацију резултата реализације програма и пројеката на домаћим и међународним конференцијама;
предлагање нових програма и пројекта за унапређивање здравственог система Републике;
планирање и финансирање здравствене заштите;
анализу, планирање и праћење финансирања здравствене заштите;
праћење и анализу финансијског пословања здравствених установа;
припрему и израду здравственог рачуна Републике;
праћење стања у области здравственог осигурања;
спровођење јавних набавки у Министарству;
планирање и програмирање капиталних улагања и инвестиција у сектору здравства;
праћење производње и промета лијекова, хемикалија, биоцида и медицинских средстава;
планирање, координацију и предузимање мјера ради обезбјеђења квалитетних, сигурних и ефикасних лијекова и коришћења лијекова и медицинских средстава у систему здравствене заштите;
остваривање права из социјалне, породичне и дјечје заштите;
планирање и функционисање система социјалне, породичне и дјечје заштите;
планирање и остваривање појединих права из социјалне заштите;
програме санације, адаптације и опремања установа социјалне заштите;
развојне програме усмјерене на унапређивање система социјалне, породичне и дјечје заштите;
надзор над стручним радом установа социјалне и дјечје заштите;
планирање и координацију додатног стручног усавршавања радника социјалне дјелатности;
увођење стандарда стручног рада и услуга које се пружају у установама социјалне заштите;
учешће у изради, припремању и спровођењу стратешких докумената и програма из области социјалне, породичне и дјечје заштите;
подстицање и унапређивање породично-правних и социјално-заштитних облика збрињавања дјеце, омладине и пунољетних лица без породичног старања;
праћење и подстицање развоја програма социјалне, породичне и дјечје заштите;
социјалне рехабилитације и оспособљавања лица са инвалидитетом;
праћење стања социјалне угрожености и социјалних потреба становништва;
подстицање и координацију социјално-хуманитарних активности;
сарадњу са невладиним и другим домаћим и међународним организацијама чија је дјелатност у вези са облашћу социјалне, породичне и дјечје заштите;
усклађивање и предлагање закона и подзаконских прописа у складу са правном тековином Европске уније, те обављање других послова у складу са законом.